GAMESSのプロファイリング

compallから読み出されるシェルスクリプトcompに説明がある．

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# To profile code during development stages,

# 1. "comp" desired modules with -pg added to the xlf flags

# 2. "lked" after adding -p to the xlf flags.

# 3. execute to completion, generating 'mon.out' file.

# 4. generate results by 'prof gamess.00.x mon.out'.

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gfortranの場合は，以下を追加

1380行（32bit）

gfortran -pg -c $OPT -std=legacy $MODULE.f

1517行（64bit）

gfortran -pg -c -fdefault-integer-8 $OPT -std=legacy $MODULE.f

GAMESSのコンパイル

GAMESSをコンパイルした．数値計算ライブラリにはAtlasを使用．

1）Atlasのコンパイル
・Atlasをダウンロード
http://sourceforge.net/projects/math-atlas/
・適当なところに解凍
・解凍したディレクトリの中に，適当なディレクトリを作る（例えばmyobj）
cd myobj
../configure -Si cputhrchk 0（CPUのclock変動を無視する．このオプションを付けないとエラー．）

2）GAMESSのコンパイル
・ダウンロード
http://www.msg.ameslab.gov/gamess/download.html
のobtaining GAMESSをクリック．agreeするとメールアドレスの登録が要求される．登録したメールアドレスにダウンロード先とパスワード（毎週変わる）が送られる．
・解凍
tar -xvzf gamess-current.tar.gz
cd gamess
・コンパイルに関する設定
./configure
Fortranはgfortran
数値演算ライブラリにはatlasを選択

configureによる設定はinstall.infoに書き込まれる（ここを手作業で修正することも可能）
・コンパイル
./compall
・ddiのコンパイル
cd ddi
./compddi
・リンク
./lked
gamess.00.xが出来る
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atlasはスカラー版がリンクされる．SMP並列版をリンクするにはlkedの一部を書き換える．
set MATHLIBS="-L$GMS_MATHLIB_PATH -lf77blas -latlas"
の行を
set MATHLIBS="-L$GMS_MATHLIB_PATH -lptf77blas -lpthread -latlas"
とする（2箇所）