HTの効果が現れない場合

同じくポリエチレンの重合度466の鎖一本を伸び切った状態で真空中で分子動力学計算した．計算時間は5psと長くしてある．並列化の効率が低下しているが，これは相互作用が鎖に沿って２次元的であるためだろう．物理４コアまでは計算時間は短くなっているが，hyperthreadingのある５〜８では寧ろ物理４コアより計算時間が遅くなっている．相互作用が２次元的な場合には，スレッド数は物理コア数までとするのがよいようだ．こうした系では，物理８コアの方が，hypethreadingで論理８コアとするよりも遥かに計算時間は短縮出来る．

Core i7とAthlon X2との比較

core i7とHyperthreadingの効果(2)

ポリエチレン１本鎖，重合度466

他の計算条件はcore i7とHyperthreadingの効果(1)とほぼ同じ．

ほぼ同じ原子数，密度であるが，連結されたことにより，計算時間が約３倍掛かっている．スレッド数に対する計算速度の向上の度合いは，（１）の場合と同程度．物理コア４＋論理コア１の５スレッドでは一旦計算速度が低下するが，６～８スレッドで計算速度が向上するのも同じ現象．

８スレッドで，物理コア６個程度の計算速度になる．

Core i7とHyperthreadingの効果(1)

Core i7をMaterials Studio 4.3でベンチマークテストした．

【系】butane 100分子，密度〜0.8cm-3，Amorphous Cellで充填

【CPU】Core i7 940 2.93 GHz, 4 core

【計算法】MD,  NVT, 0.1ps, 298K

【力場】compass

スレッド数の逆数に対して，CPU timeをプロットした．

物理コア数と同じスレッド数４までは順調に伸びているが，スレッド５では４よりも速度が落ちる（グラフで跳ね上がっているところ）．複数回実行しても同じ結果になった．スレッド６〜８は，物理コア並みの速度アップである．スレッド８で論理コア数８と同じになる．この時の速度は実質物理コア６程度ではないかと思われる．無機物や分子集合系のシミュレーションでは，コア数の効果は大きく，hyperthreadingも効く様である．

物理４コアまでの直線を外挿すると，物理６コアで3.60 s，物理８コアで2.97 sとなった．